На живописном берегу реки Карповки в Санкт-Петербурге расположен Свято-Иоанновский ставропигиальный женский монастырь. Он был основан Иоанном Кронштадтским и назван в честь преподобного Иоанна Рыльского, который был его духовным покровителем.

Иоанн Кронштадтский родился в селе Сура на реке Пинеге в Архангельской губернии. В 1899 году он основал там женскую монашескую Иоанно-Богословскую обитель. А в Петербурге он решил организовать подворье Сурского монастыря, чтобы монахини могли останавливаться в столице. Но земля была очень дорогой. Купить подходящий участок сразу было невозможно. Неожиданно появился благотворитель. Один из почитателей батюшки предложил ему свой участок площадью 500 квадратных саженей на берегу реки Карповки. Этим благотворителем был почётный гражданин С. Г. Раменский.
Новость о строительстве новой обители, инициатором которой стал известный священник, быстро распространилась по всей России. Пожертвования поступали со всех сторон, и вскоре территория монастыря была расширена. Проект монастыря был впечатляющим даже на бумаге. Его разработал архитектор-самоучка Н. Н. Никонов. План будущей обители был утверждён лично императором Николаем II.
Монастырь отстроили всего за два года. Здание сочли одним из красивейших сооружений Петербурга. Иоанн Кронштадский тогда написало митрополиту Антонию: "Я нашел, что это сооружение в столице слишком художественно и обширно, чтобы ему быть подворьем. Ему лучше быть Петербургским самостоятельным женским монастырем". Его просьба была исполнена, и Сурское подворье стало Свято-Иоанновским женским монастырем.

Из-за небольшой территории все монастырские службы находились в одном здании, где были расположены сразу три храма. Это был уникальный случай. Верхний храм был посвящён Двенадцати апостолам, средний — святому Иоанну Рыльскому, покровителю Иоанна Кронштадтского, а нижний — пророку Илие и святой царице Феодоре, так звали родителей родителей Иоанна Кронштадтского.
Первыми насельницами монастыря стали инокини Сурской обители во главе с матушкой Ангелиной. Она была духовной дочерью отца Иоанна и всегда во всём помогала ему. Также она активно участвовала в строительстве новой обители. За эти труды определением Святейшего Синода она была награждена наперсным крестом, а позже возведена в сан игуменьи.
Матушка Ангелина, посмотрев на план будущего монастыря, не нашла на нём кладбища, хотя оно было обязательным элементом любого монастыря. Оказалось, что это было сделано по инициативе отца Иоанна. Он сказал: «Моим сёстрам не нужно будет кладбище, они, как птицы, разлетятся по всему миру». Эти слова оказались пророческими в 1920-е годы.
Молельная комната о.Иоанна Кронштадтского. Иоанн называл себя «Божиею милостию строитель Иоанновского монастыря». Он сам выбрал место для своего упокоения и обратился с этой просьбой к митрополиту Антонию.15 декабря 1904 года Николай II написал на докладе: «Разумеется, желание почтенного о. Иоанна Сергиева будет исполнено».

Усыпальница Иоанна Кронштадтского. 20 декабря 1908 года отец Иоанн скончался. Эта новость быстро разлетелась по столице, во всех храмах сразу же начались панихиды. Толпы направились в Кронштадт, а затем процессия двинулась по льду Финского залива в Петербург. 23 декабря отец Иоанн был погребен в нижнем храме своей обители.